Решение:
Месяца два после свадьбы мой отчим служил на пристани в конторе, (1) и, (2) хотя очень тяжело было видеть, (3) как он приходит и садится на то место, (4) где прежде сидел отец, (5) и ест его ложкой из его тарелки, (6) всё-таки можно было ещё жить, возвращаясь домой, (7) когда он уже спал.
Запятая под номером 1 ставится между частями сложного предложения: «Месяца два после свадьбы мой отчим служил на пристани в конторе» и «всё-таки можно было ещё жить, возвращаясь домой». Первый союз И соединяет именно эти части, несмотря на то, что стоят они друг от друга далеко и между ними вклиниваются другие части предложения.
Запятые под номерами 2 и 3 выделяют придаточную часть «хотя очень тяжело было видеть».
Запятая на стыке союзов И... ХОТЯ ставится и перед союзом и, и после него, т. к. союз соединяет два простых предложения, причем после придаточной части не следует вторая часть двойного союза.
Запятые под номерами 4 и 5 выделяют придаточное предложение «где прежде сидел отец».
Запятые под номерами 3 и 6 одновременно выделяют придаточное «как он приходит и садится на то место ... и ест его ложкой из его тарелки»
Запятая под номером 7 выделяет придаточное «когда он уже спал»
Источник: Реальные задания (ЕГЭ, ФИПИ, Цыбулько)